Surveillance épidémiologique
Epidemiological surveillance is vital in the battle against infectious diseases. We support the collection, analysis, and interpretation of health data in an effort to the plan, implement, and evaluate public health in Cameroon and across Africa.
1. Laboratoire de référence et de coordination du réseau des laboratoires de diagnostic biologique du Choléra au Cameroun
Synthèse des échantillons des cas suspects de selles des cas suspects reçus et analysés au LNSP de janvier à juillet 2024.
Au cours du premier semestre de l’année 2024, le LNSP a reçu et analysé par culture 18 échantillons de selles des cas suspects, dont 01 positif au Vibrio cholerae O1 (5,55%). Ces échantillons provenaient des districts de santé : SOA (03), Nkolbisson (01), SA’A (01), Awae (02), Djoungolo (10) de la région du Centre et Ebolowa (01) de la région du Sud. L’échantillon du cas positif au Vibrio cholerae O1, sérotype OGAWA provenait du district de santé Soa et confirmé par culture le 26 avril 2024.
2. Préparation et riposte contre l’épidémie coqueluche dans la région du Centre
- Elaboration des procédures de prélèvement, de conditionnement et d’acheminement des échantillons des cas suspects de coqueluche
- Briefing sur le prélèvement des échantillons par le LNSP dans les districts de santé ayant notifié les cas (Sa’a et Ndikiniméki)
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Appui de l’Institut Pasteur de Bangui pour le testing des 21 premiers échantillons prélevés dans la région du Centre
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Du 29/07 au 02/08/2024 : Formation du personnel du Laboratoire National de Santé Publique et du Centre Pasteur de Yaoundé au diagnostic moléculaire de la coqueluche
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Elaboration des procédures de diagnostic bactériologique et moléculaire de la coqueluche.
3.Évaluation de la performance du test de diagnostic rapide antigène SARS-CoV-2 de marque Boson Biotech comparé au test PCR sur GeneXpert, Yaoundé Cameroun, avril 2024
Suite à l’acquisition du nouveau TDR Ag SARS-CoV-2 de marque Boson Biotech par le MINSANTE, Le LNSP, Laboratoire national de référence pour le diagnostic de la COVID-19 et de coordination de la décentralisation de ce diagnostic au Cameroun a été sollicité le 07 Mars 2024 par le CCOUSP pour évaluer ce nouveau TDR Ag SARS-CoV-2. Le LNSP a procédé à l’évaluation de ce nouveau TDR Ag, en prenant comme test de référence la PCR SARS-CoV-2 sur GeneXpert.
Du 07 mars au 04 Avril 2024, un total de 106 échantillons nasopharyngés dont 53 hommes, 53 femmes et l’âge median : 32,5 ans (2-87 ans) a été prélevés dans deux sites de surveillance sentinelle de la grippe dans la ville de Yaoundé. Les TDR Ag SARS-CoV-2 de marque boson Biotech ont été réalisés sur site et la PCR SARS-CoV-2 sur GeneXpert au LNSP. Nous avons obtenu une Sensibilité : 88,90% (95%Cl : 68,5-100,0) et une Spécificité : 100%. La performance de ce nouveau TDR Ag SARS-CoV-2 de marque Boson Biotech correspond aux exigences minimales de performances des tests rapides homologués par l´OMS. Il pourrait être utilisé pour le diagnostic précoce de la COVID-19 en communauté et comme alternatif pour le test PCR SARS-CoV-2.
4.Contribution du LNSP à la surveillance des sous-lignées du variant Omicron du virus SARS-CoV-2 au Cameroun : riposte à la flambée de COVID-19 dans la Prison Centrale de Mbalmayo, Région du Centre, janvier 2024
Selon le rapport de situation COVID-19 au Cameroun N°214 du 08 au 14 janvier 2024, l’épidémie était globalement sous contrôle dans tous les districts de santé. Cependant, à la semaine épidémiologique 03, année 2024, la Prison Centrale de Mbalmayo, région du Centre a notifié une flambée de cas de COVID-19 suite à la confirmation de 105 cas au cours d’une investigation préliminaire par les tests rapides antigènes SARS-CoV-2. Dans sa mission d’appui à la santé publique, le LNSP a mené une investigation approfondie dont l’objectif était de collecter les échantillons et identifier le variant du SARS-CoV-2 en circulation dans ce milieu carcéral.
Un total de 327 échantillons a été collecté dont 322 détenus et 05 personnels administratifs, avec 312 hommes (95,4%), 15 femmes (4,6%) et 203 vaccinés contre la COVID-19 (62,0%, au moins une dose). L’âge median : 29 ans (12-77 ans) et un sexe ratio H/F : 26,25.
Les analyses PCR SARS-CoV-2 réalisées par le LNSP ont révélé 121 échantillons positifs (116 hommes et 05 femmes) soit un taux de positivité de 37%. Les 121 cas positifs étaient repartis dans presque tous les 12 locaux et le bloc administratif de ce milieu carcéral.
Le séquençage génomique de 124 échantillons (121 du milieu carcéral et 3 autres du LNSP pour le mois janvier 2024) a permis d’obtenir 68 génomes complets du SARS-CoV-2, soit un taux de réussite de 54,84%. La distribution des sous-lignées du variant omicrons détectés : B.1.617.2 (4,41%) ; BA.5 (2,94%) ; JN.1 (92,65%).
Nous pouvons noter que la sous-lignée du variant préoccupant omicron JN.1 a été détecté pour la première fois au Cameroun et est responsable de la flambée actuelle de COVID-19 au sein de la prison centrale de Mbalmayo.
Les mesures de contrôles et une vaccination de masse ont été réalisées dans ce milieu carcéral.
